Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi (KMÜ) İslami İlimler Fakültesi bünyesinde bölüm, anabilim dalı ve bilim dalları kurulması kararı, Yükseköğretim Kurulu tarafından onaylandı. Yükseköğretim Kurulunun 13 Mart 2013 tarihinde yaptığı toplantısında fakülteye 4 bölüm, 10 ana bilim ve 25 bilim dalı kurulması kararlaştırıldı.  
Alınan kararla KMÜ’de Temel İslam Bilimleri, Felsefe ve Din Bilimleri, İslam Tarihi ve Sanatları, İlköğretim Din Kültürü ve Ahlak Bilgisi Eğitimi Bölümleri açılmış oldu. 

İslami İlimler Fakültesinde açılan bölümlerin üniversiteyi akademik anlamda geliştireceğini belirten KMÜ Rektörü Prof. Dr. Sabri Gökmen, “Genç bir üniversite olarak akademik ve idari birimlerimiz için en uygun fiziki mekânlar, yeniliğe ve gelişmeye açık zihinler, sevgiye ve hoşgörüye adanmış gönüller inşa etmek için gayret gösteriyoruz.” dedi.

Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi İslami İlimler Fakültesinde açılan bölüm, ana bilim ve bilim dalları şunlar:

Temel İslam Bilimleri Bölümü
Tefsir Anabilim Dalı
Tefsir Tarihi ve Usulü Bilim Dalı 
Tefsir Bilim Dalı
Kur’an-ı Kerim’i Okuma ve Kıraat İlmi Bilim Dalı
Hadis Anabilim Dalı
Hadis Tarihi ve Usulü Bilim Dalı
Hadis Bilim Dalı 
İslam Hukuku Anabilim Dalı
İslam Hukuku Tarihi ve Usulü Bilim Dalı
İslam Hukuku Bilim Dalı
Kelam ve İslam Mezhepleri Tarihi Anabilim Dalı
Kelam Tarihi Bilim Dalı
Kelam Bilim Dalı
İslam Mezhepleri Tarihi Bilim Dalı
Tasavvuf Anabilim Dalı
Tasavvuf Tarihi Bilim Dalı
Tasavvuf Bilim Dalı
Arap Dili ve Belagatı Anabilim Dalı
Felsefe ve Din Bilimleri Bölümü
İslam Felsefesi Anabilim Dalı
İslam Ahlakı Bilim Dalı
Mantık Bilim Dalı
Din Bilimleri Anabilim Dalı
Din Sosyolojisi Bilim Dalı
Din Psikolojisi Bilim Dalı 
Din Eğitimi Bilim Dalı
Dinler Tarihi Bilim Dalı
Din Felsefesi Bilim Dalı
İslam Tarihi ve Sanatları Bölümü
İslam Tarihi Anabilim Dalı
Siyer Bilim Dalı
İslam Tarihi Bilim Dalı
İslam Medeniyeti Tarihi Bilim Dalı
Türk-İslam Edebiyatı ve İslam Sanatları Anabilim Dalı
Türk-İslam Edebiyatı Bilim Dalı
İslam Sanatları Bilim Dalı
Türk Din Musikisi Bilim Dalı
İlköğretim Din Kültürü ve Ahlak Bilgisi Eğitimi Bölümü