İlk olarak; Aksaray, Karaman, Konya ve Niğde’de bulunan bölge üniversitelerinin bir araya gelmesi ile kurulan ardından 2016 yılında Bakanlar Kurulu kararlarıyla görev sahasına Kırıkkale, Kırşehir, Nevşehir ve Yozgat illerinin de eklenmesiyle genişleyen UNİKOP’ta, her yıl kuruluş tarihlerine göre bir üniversite dönem başkanlığı görevini yürütüyor. Necmettin Erbakan Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Muzaffer Şeker’in ev sahipliğini yaptığı ‘Dönem Başkanlığı Devir Teslim Töreni’ne; KOP Bölge Kalkınma İdaresi Başkanı İhsan Bostancı, Selçuk Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Mustafa Şahin, Niğde Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Muhsin Kar, Aksaray Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Yusuf Şahin, Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Mehmet Akgül, KTO Karatay Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Bayram Sade, Necmettin Erbakan Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Muzaffer Şeker, Konya Gıda ve Tarım Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Cumhur Çökmüş, Bozok Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Salih Karacabey, Nevşehir Hacı Bektaş Veli Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Mazhar Bağlı, Kırıkkale Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Ekrem Yıldız ve Ahi Evran Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Vatan Karakaya katıldı. Üniversitenin, Ahmet Keleşoğlu İlahiyat Fakültesi Toplantı Salonunda gerçekleştirilen törende; 2018 yılı UNİKOP dönem başkanlığı görevini Necmettin Erbakan Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Muzaffer Şeker, bir önceki dönem başkanı KTO Karatay Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Bayram Sade’den devraldı. 2013 yılında Selçuk Üniversitesi ile başlayan UNİKOP Dönem Başkanlığı görevini 2014 yılında Niğde Üniversitesi, 2015 yılında Aksaray Üniversitesi, 2016 yılında Karamanoğlu Mehmet Bey Üniversitesi, 2017 yılında KTO Karatay Üniversitesi üstlendi. KOP Bölgesi üniversiteleri arasında eğitim-öğretim, araştırma-geliştirme ve toplumsal hizmet gibi alanlarda akademik ve idari işbirlikleri yapmak, üniversite-sanayi etkileşimini ve üniversite-şehir bütünleşmesini ileri düzeye taşımak ve ülkemizin gelecek vizyonuna ve kalkınma çabalarına katkı sağlamak amacıyla KOP Bölge Kalkınma İdaresi Başkanlığı’nın desteği ve koordinasyonu ile kurulan KOP Bölgesi Üniversiteler Birliği (UNİKOP) son olarak Nevşehir’de yeni kurulan Kapadokya Üniversitesinin de üyelik başvurusu ile genişlemesini sürdürüyor.